kamniroИсследования водных биологических ресурсов Камчатки и северо-западной части Тихого океанаThe researches of the aquatic biological resources of Kamchatka and the North-West Part of the Pacific Ocean2072-82122782-6236«КамчатНИРО»10.15853/2072-8212.2021.63.89-101kamniro-180Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ НАУЧНЫЕ СТАТЬИFULL ARTICLESОсобенности циркуляции вируса инфекционного некроза гемопоэтической ткани в популяции нерки оз. Курильского (Камчатка)Particular qualities of infectious hematopoietic necrosis virus circulation in the sockeye population at Kurile Lake (Kamchatka)РудаковаС. Л.RudakovaS. L.

Зав. лабораторией, кандидат биологических наук

683000 Петропавловск-Камчатский, Набережная, 18

Svetlana L. Rudakova, Head of Lab., Ph. D. (Biology)

683000 Petropavlovsk-Kamchatsky, Naberezhnaya, 18

rudakova@kamniro.ruБочковаЕ. В.BochkovaE. V.

Ведущий специалист

683000 Петропавловск-Камчатский, Набережная, 18

Elena V. Bochkova, Leading Specialist

683000 Petropavlovsk-Kamchatsky, Naberezhnaya, 18

 

bochkova.e.v@kamniro.ruДубынинВ. А.DubyninV. A.

Главный специалист

683000 Петропавловск-Камчатский, Набережная, 18

Vladimir A. Dubynin, Leading Specialist

683000 Petropavlovsk-Kamchatsky, Naberezhnaya, 18

dubynin.v.a@kamniro.ruМюгеН. С.MugueN. S.

Начальник отд., кандидат биологических наук

107140 Москва, ул. Верхняя Красносельская, д. 17

Nikolai S. Mugue, Head of Dep., Ph. D. (Biology)

107140 Moscow, Verhnyaya Krasnoselskaya, д. 17.

 

mugue@mail.ruБатсБ.BattsB.

Ведущий специалист, кандидат биологических наук

Сиэтл

Bill Batts, Leading Specialist

6505 NE 65th Street Seattle

bbatts@usgs.govБрейтаР. Б.BreytaR. B

Ведущий специалист, кандидат биологических наук; Департамент микробиологии

Корваллис, шт. Орегон

Rachel B. Breyta, Leading Specialist, Ph. D.; Department of Microbiology

2820 SW Campus. Way, Corvallis, OR 97331

rbjmax@uw.eduКюрафГ.KurathG.

Зав. лабораторией молекулярной генетики, кандидат биологических наук

Сиэтл

Gael Kurath, Head of Lab., Ph. D.

6505 NE 65th Street Seattle

gkurath@usgs.govКамчатский филиал Всероссийского научно-исследовательского института рыбного хозяйства и океанографии («КамчатНИРО»)РоссияKamchatka Branch of Russian Research Institute of Fisheries and Oceanography (“KamchatNIRO”)Russian FederationВсероссийский научно-исследовательский институт рыбного хозяйства и океанографииРоссияRussian Research Institute of Fisheries and OceanographyRussian FederationЗападный исследовательский центр рыболовстваСоединённые Штаты АмерикиU.S.G.S. Western Fisheries Research CenterUnited StatesУниверситет штата ОрегонСоединённые Штаты АмерикиOregon State UniversityUnited StatesЗападный исследовательский центр рыболовстваСоединённые Штаты АмерикиOregon State UniversityUnited States20212206202206389101Copyright © Рудакова С.Л., Бочкова Е.В., Дубынин В.А., Мюге Н.С., Батс Б., Брейта Р.Б., Кюраф Г., 20222022Рудакова С.Л., Бочкова Е.В., Дубынин В.А., Мюге Н.С., Батс Б., Брейта Р.Б., Кюраф Г.Rudakova S.L., Bochkova E.V., Dubynin V.A., Mugue N.S., Batts B., Breyta R.B., Kurath G.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://kamniro.elpub.ru/jour/article/view/180

Многолетние (2004–2021 гг.) вирусологические исследования показали, что оз. Курильское является природным очагом вируса инфекционного некроза гемопоэтической ткани (IHNV), в котором выработался и поддерживается гомеостаз. Филогенетические исследования продемонстрировали уникальность типичных изолятов IHNV в области midG, выделенных у нерки, что поддерживает гипотезу замкнутой циркуляции вируса в природном очаге оз. Курильского, без заноса из других водоемов Камчатки.

Long-term (2004–2018) virological studies have shown that the Kurile Lake is a natural focus of infectious hematopoietic necrosis virus (IHNV). A hypothesis about the survival of the virus as a species is discussed. The results of the phylogenetic analysis of the midG region showed that typical IHNV genetic sequences found in sockeye salmon from Kurile Lake are unique and have single mutations. This confirms the assumption that the lake is a closed system, and fish from other reservoirs were not brought into it.

ВИРУС ИНФЕКЦИОННОГО НЕКРОЗА ГЕМОПОЭТИЧЕСКОЙ ТКАНИНЕРКАПРИРОДНЫЙ ОЧАГ ИНФЕКЦИИПАТОГЕНХОЗЯИНЭПИЗООТИЧЕСКИЙ ПРОЦЕССINFECTIOUS HEMATOPOIETIC NECROSIS VIRUSSOCKEYE SALMONNATURAL FOCUS OF INFECTIONPATHOGENHOSTEPISOOTIC PROCESSReferencesАпасова Л.Ю., Мороз Н.В., Рыбаков С.С., Еремее­ ва Т.Б. 2009. Очистка и концентрирование вируса инфекционного некроза гемопоэтической ткани лососевых рыб // Тр. Федер. центра охраны здоровья животных. Т. 7. С. 234–239.Apasova L.Yu., Moroz N.V., Rybakov S.S., Yeremeyeva T.B. Purification and concentration of salmon infectious hematopoietic necrosis virus. Trudy Federalnogo tsentra okhrany zdoroviya zhivotnykh, 2009, vol. 7, pp. 234–239. (In Russian)Бугаев В.Ф. 2011. Азиатская нерка – 2 (биологическая структура и динамика численности локальных стад в конце XX – начале XXI вв.). ПетропавловскКамчатский: Камчатпресс, 380 с.Bugaev V.F. Aziatskaya nerka – 2 (Biologicheskaya struktura i dinamika chislennosti lokalʼnykh stad v kontse XX – nachale XXI vv. [Asian sockeye salmon – 2 (biological structure and population dynamics of local stocks in the late XX – early XXI centuries)]. Petropavlovsk-Kamchatsky: Kamchatpress, 2011, 380 p.Бугаев В.Ф., Кириченко В.Е. 2008. Нагульно-нерестовые озера азиатской нерки (включая некоторые другие водоемы ареала). Петропавловск-Камчатский: Камчатпресс, 280 с.Bugayev V.F., Kirichenko V.Ye. Nagulno­nerestovyye ozera aziatskoy nerki (vklyuchaya nekotoryye drugiye vodoyemy areala) [Feeding and spawning lakes of Asian sockeye salmon (including some other water bodies of the range)]. Petropavlovsk-Kamchatsky: Kamchatpress, 2008, 280 p.Дудников С.А. 2004. Количественная эпизоотология: основы прикладной эпидемиологии и биостатистики. Владимир: Демиург, 460 с.Dudnikov S.A. Kolichestvennaya epizootologiya: os­ novy prikladnoy epidemiologii i biostatistiki [Quantitative epidemiology: fundamentals of applied epidemiology and biostatistics]. Vladimir: Demiurg, 2004, 460 p.Власов В.В. 2004. Эпидемиология: Учеб. пособие для вузов. М.: Гэотар-Мед, 464 с.Vlasov V.V. Epidemiologiya: Ucheb. posobiye dlya vuzov [Epidemiology: Proc. allowance for universities]. Moscow: Geotar-Med, 2004, 464 p.Завьялова Е.А., Дрошнев А.Е., Богданова П.Д., Бу­ лина К.Ю., Гулюкин М.Ч. 2017. Анализ текущей эпизоотической ситуации по болезням рыб в России // Scientific light. № 2. С. 47–51.Zavyalova E.A., Droshnev A.E., Bogdanova P.D., Bulina K.Yu., Gulyukin M.I. Аnalysis of the current epizootic situation on fishesʼ diseases in Russia. Sci­ entific light, 2017, no. 2, pp. 47–51. (In Russian) Kolomeytsev V.V., Lepskaya E.V. Variations of hydrometeorological conditions in the basin of Kurile Lake (Kamchatka) in summer period for 1976–2020. Connection with global climatic changes. The researchers of the aquatic biological resources of Kamchatka and of the north-west part of the Pacific Ocean, 2021, vol. 63, pp. 9–29. (In Russian)Коломейцев В.В., Лепская Е.В. 2021. Изменчивость гидрометеорологических условий в бассейне озера Курильского (Камчатка) в летний период 1976– 2020 гг. Связь с глобальными климатическими индексами // Исслед. водн. биол. ресурсов Камчатки и сев.-зап. части Тихого океана: Сб. науч. тр. КамчатНИРО. Вып. 63. С. 9–29.Korenberg E.I. Chto takoye prirodnyy ochag [What is a natural hearth]. Moscow: Znaniye, 1983, 64 p.Коренберг Э.И. 1983. Что такое природный очаг. М.: Знание, 64 с.Korenberg E.I. Natural foci of infections: current problems and prospects for research. Zoologich. Zhurnal, 2010, vol. 89, no. 1, pp. 5–17. (In Russian)Коренберг Э.И. 2010. Природная очаговость инфекций: современные проблемы и перспективы исследований // Зоологич. журнал. Т. 89, № 1. С. 5–17.Lepskaya E.V., Maslov A.V. Long-term changes of hydrometeorological conditions in the Basin of Kurilskoye Lake (Kamchatka) and features of “fish” phosphorus transformation in the lacustrine ecosystem. Izvestiya TINRO, 2009, vol. 158, pp. 293–302. (In Russian)Лепская Е.В., Маслов А.В. 2009. Долгосрочные изменения гидрометеорологической обстановки в бассейне озера Курильского (Камчатка) и особенности трансформации «рыбного» фосфора в озерной экосистеме // Изв. ТИНРО. Т. 158. С. 293–302.Litvin V.Yu., Korenberg E.I. Natural foci of diseases: development of the concept by the end of the century. Parasitology, 1999, no. 33 (3), pp. 179–191. (In Russian)Литвин В.Ю., Коренберг Э.И. 1999. Природная очаговость болезней: развитие концепции к исходу века // Паразитология. № 33 (3). С. 179–191.Likhatovich J. Losos bez rek. Istoriya krizisa tikhookeanskikh lososey [Salmon without rivers. History of the Pacifi Salmon Crisis]. Vladivostok, 2004, 376 p.Лихатович Дж. 2004. Лосось без рек. История кризиса тихоокеанских лососей. Владивосток: Изд-во «Дальний Восток». 376 с.Nikolaev A.S., Nikolaeva E.T. Some aspects of the limnological classifi of sockeye salmon lakes in Kamchatka. The researchers of the aquatic biological resources of Kamchatka and of the north-west part of the Pacifi Ocean, 1991, vol. 1, pp. 3–17. (In Russian)Николаев А.С., Николаева Е.Т. 1991. Некоторые аспекты лимнологической классификации нерковых озер Камчатки // Исслед. биологии и динамики численности промысловых рыб Камчатского шельфа. Петропавловск-Камчатский. Вып. 1, ч. 1. С. 3–17.Rudakova S.L. Necrosis of hematopoietic tissue in sockeye salmon producers and alleged sources of infection. Problems of Fisheries, 2003, vol. 4, no. 1 (13), pp. 93–102.Рудакова С.Л. 2003. Некроз гемопоэтической ткани у производителей нерки и предполагаемые источники инфекции // Вопр. рыболовства. Т. 4, № 1 (13). С. 93–102.Rudakova S.L. Descriptive model of the infectious hematopoietic necrosis virus distribution in a sockeye population. Izvestiya TINRO, 2008, vol. 152, pp. 140–152. (In Russian)Рудакова С.Л. 2008. Описательное моделирование распространения вируса инфекционного некроза гемопоэтической ткани в популяции нерки // Изв. ТИНРО. Т. 152. С. 140–152.Rudakova S.L, Bochkova E.V. A modern approach to the monitoring of infectious hematopoietic necrosis virus (IHNV) in Kamchatka populations of sockeye Оncorhynchus nerka (Salmoniformes, Salmonidae). Problems of Fisheries, 2003, vol. 14, no. 3 (55), pp. 496–509. (In Russian)Рудакова С.Л., Бочкова Е.В. 2013. Современный подход к мониторингу превалентности вируса инфекционного некроза гемопоэтической ткани (IHNV) в камчатских популяциях нерки Оncorhynchus nerka (Salmoniformes, Salmonidae) // Вопр. рыболовства. Т. 14, № 3 (55). С. 496–509.Sbornik instruktsiy po borʼbe s boleznyami ryb. Ch.1 [Collection of instructions for combating fish diseases. Part 1]. Moscow: Marketing department of AMBagro, 1998, 310 p.Сборник инструкций по борьбе с болезнями рыб. 1998. Ч. 1. М.: Отдел маркетинга АМБагро. 310 с.Batts В., Rudakova S., Bochkova E., Breyta R., Kurath G. Comparison of Russian IHNV Glycoprotein Sequences to Historical Virus Strains / 58th Western Fish Disease Workshop on June 20–22, 2017 at the Clearwater Resort, Suquamish, Washington. P. 45.Batts В., Rudakova S., Bochkova E., Breyta R., Kurath G. 2017. Comparison of Russian IHNV Glycoprotein Sequences to Historical Virus Strains / 58th Western Fish Disease Workshop on June 20–22, 2017 at the Clearwater Resort, Suquamish, Washington. P. 45.Bootland L.M., Leong J.C. Infectious hematopoietic necrosis virus // Woo P.T.K. and Bruno D.W. (eds.). Fish diseases and disorders. 1999. Vol. 3: Viral, bacterial and fungal infectious CAB International. P. 57–112.Bootland L.M., Leong J.C. 1999. Infectious hematopoietic necrosis virus // Woo P.T.K. and Bruno D.W. (eds.). Fish diseases and disorders. Vol. 3: Viral, bacterial and fungal infectious CAB International. P. 57–112.Dixon P. Epidemiological characteristics of infectious hematopoietic necrosis virus (IHNV): a review // Veterinary Research, 2016, vol. 47 (1). P. 1–63.Dixon P. 2016. Epidemiological characteristics of infectious hematopoietic necrosis virus (IHNV): a review // Veterinary Research. Vol. 47 (1). P. 1–63.Drolet B.S., Chiou P.P. Detection of truncated virus particles in a persistent RNA virus infection in vivo // Journal of Virology. 1995. № 69 (4). P. 2140–2147.Drolet B.S., Chiou P.P. 1995. Detection of truncated virus particles in a persistent RNA virus infection in vivo // Journal of Virology. № 69 (4). P. 2140–2147.Emmenegger E.J., Meyer T.R., Burton T.O., Kurath G. Genetic diversity and epidemiology of infectious hematopoietic necrosis virus in Alaska // Diseases of Aquatic Organisms. 2000. Vol. 40. P. 163–176.Emmenegger E.J., Meyer T.R., Burton T.O., Kurath G. 2000. Genetic diversity and epidemiology of infectious hematopoietic necrosis virus in Alaska // Diseases of Aquatic Organisms. Vol. 40. P. 163–176.Garver K.A., Troyer R.M., Kurath G. Two distinct phylogenetic clades of infectious hematopoietic necrosis virus overlap within the Columbia River basin // Dis­ eases of Aquatic Organisms. 2003. Vol. 55. P. 187–203.Garver K.A., Troyer R.M., Kurath G. 2003. Two distinct phylogenetic clades of infectious hematopoietic necrosis virus overlap within the Columbia River basin // Diseases of Aquatic Organisms. Vol. 55. P. 187–203.Korenberg E.I. Population principles in research into natural focality of zoonoses // Sov. Sci. Rev. F. Physiol. Gen. Biol. 1989. № 3. P. 301–351.Korenberg E.I. 1989. Population principles in research into natural focality of zoonoses // Sov. Sci. Rev. F. Physiol. Gen. Biol. № 3. P. 301–351.Kurath G. Molecular epidemiology and evolution of fish Novirhabdoviruses / G. Kurath / Rhabdoviruses: Molecular taxonomy, Evolution, Genomics, Ecology, Cytopathology and Control. Caister Academic Press. 2014. P. 89–117.Kurath G. 2014. Molecular epidemiology and evolution of fi Novirhabdoviruses / G. Kurath / Rhabdoviruses: Molecular taxonomy, Evolution, Genomics, Ecology, Cytopathology and Control. Caister Academic Press. P. 89–117.Kurath G., Garver K.A., Troyer R.M., Emmenegger E.J., Einer-Jensen K., Anderson E.D. Phylogeography of infectious hematopoietic necrosis virus in North America // Journal of General Virology. 2003. № 84. P. 803–814. doi 10.1099/vir.0.18771-0Kurath G., Garver K.A., Troyer R.M., Emmenegger E.J., Einer-Jensen K., Anderson E.D. 2003. Phylogeography of infectious hematopoietic necrosis virus in North America // Journal of General Virology. № 84. P. 803– 814. doi 10.1099/vir.0.18771-0Manual of Diagnostic Tests for Aquatic Animals. 2021. World Organisation for Animal Health (OIE). [Electronic resourse]: URL: https://www.oie.int/en/what-we-do/standards/codes-and-manuals/aquaticmanual-online-access (дата обращения 08.06.2021)Manual of Diagnostic Tests for Aquatic Animals. 2021. World Organisation for Animal Health (OIE). [Electronic resourse]: URL: https://www.oie.int/en/ what-we-do/standards/codes-and-manuals/aquaticmanual-online-access (дата обращения 08.06.2021)McDaniel T.R. Alaska sockeye salmon culture manual / T.R. McDaniel, K.M. Pratt, T.R. Meyers, T.D. Ellison, J.E. Follett, J.A. Burke / Special fisheries report number Alaska Department of Fish and Game. Div. Commer. Fish., Manag. Develop. 1994. Alaska. 40 p.McDaniel T.R. 1994. Alaska sockeye salmon culture manual / T.R. McDaniel, K.M. Pratt, T.R. Meyers, T.D. Ellison, J.E. Follett, J.A. Burke / Special fisheries report number Alaska Department of Fish and Game. Div. Commer. Fish., Manag. Develop. Alaska. 40 p.Meyers T.R., Tomas J.B., Follet J.E., Saft R.R. Infectious hematopoietic necrosis virus: trend in prevalence and risk management approach in Alaskan sockeye salmon culture // Journal of Aquatic Animal Health. 1990. № 2. P. 85–98.Meyers T.R., Tomas J.B., Follet J.E., Saft R.R. 1990. Infectious hematopoietic necrosis virus: trend in prevalence and risk management approach in Alaskan sockeye salmon culture // Journal of Aquatic Animal Health. № 2. P. 85–98.Mulcahy D., Pascho R.J. Vertical transmission of infectious hematopoietic necrosis virus in sockeye salmon, Oncorhynchus nerka (Walbaum): isolation of virus from dead eggs and fry // Journal of Fish Diseases. 1985. № 8. Р. 393–396. doi 10.1111/j.1365-2761.1985.Mulcahy D., Pascho R.J. 1985. Vertical transmission of infectious hematopoietic necrosis virus in sockeye salmon, Oncorhynchus nerka (Walbaum): isolation of virus from dead eggs and fry // Journal of Fish Diseases. № 8. Р. 393–396. doi 10.1111/j.13652761.1985.tb00962.xtb00962.xMulcahy D., Pascho R.J., Jenes C.K. 1983. Detection of infectious hematopoietic necrosis virus in river water and demonstration of waterborne transmission // Journal of Fish Diseases. № 6. P. 321–330.Mulcahy D., Pascho R.J., Jenes C.K. Detection of infectious hematopoietic necrosis virus in river water and demonstration of waterborne transmission // Journal of Fish Diseases. 1983. № 6. P. 321–330.Nichol S.T., Rowe J.E., Winton J.R. 1995. Molecular epizootiology and evolution of the glycoprotein and non-virion protein genes of infectious hematopoietic necrosis virus, a fish rhabdovirus // Journal of Virus Research. № 38. P. 159–173.Nichol S.T., Rowe J.E., Winton J.R. Molecular epizootiology and evolution of the glycoprotein and non-virion protein genes of infectious hematopoietic necrosis virus, a fish rhabdovirus // Journal of Virus Research. 1995. № 38. P. 159–173.Reno P.W. 1998. Factors involved in the dissemination of disease in fi populations // Journal of Aquatic Animal Health. Vol. 10, Issue 2. P. 160–171.Reno P.W. Factors involved in the dissemination of disease in fi populations // Journal of Aquatic Animal Health. 1998. Vol. 10, Issue 2. P. 160–171.Rucker R.R., Whipple W.J., Parvin J.R., Evans C.A. 1953. A contagious disease of salmon possibly of virus origin. United States Fish and Wildlife Service Fishery Bulletin. Vol. 54. P. 35–46.Rucker R.R., Whipple W.J., Parvin J.R., Evans C.A. A contagious disease of salmon possibly of virus origin. United States Fish and Wildlife Service Fishery Bulletin. 1953. Vol. 54. P. 35–46.Rudakova S.L., Kurath G., Bochkova E.V. 2007. Occurrence and Genetic Typing of Infectious Hematopoietic Necrosis Virus in Kamchatka Russia // Diseases of Aquatic Organisms. Vol. 75. Р. 1–11.Rudakova S.L., Kurath G., Bochkova E.V. Occurrence and Genetic Typing of Infectious Hematopoietic Necrosis Virus in Kamchatka Russia // Diseases of Aquatic Organisms. 2007. Vol. 75. Р. 1–11.Smith E.M., Gerba C.P., Melnik J.L. 1978. Role of sediment in the persistence of enteroviruses in the estuarine environment // Applied and Environmental Microbiology. № 35. P. 685–689.Smith E.M., Gerba C.P., Melnik J.L. Role of sediment in the persistence of enteroviruses in the estuarine environment // Applied and Environmental Microbiology. 1978. № 35. P. 685–689.Swoff d D.L. 1998. PAUP* Phylogenetic Analysis Using Parsimony (*and Other Methods), Version 4. Sinauer Associates, Sunderland, MA. P. 56–76.Swofford D.L. PAUP* Phylogenetic Analysis Using Parsimony (*and Other Methods), Version 4. Sinauer Associates, Sunderland, MA. 1998. P. 56–76.Troyer R.M., Kurath G. 2003. Molecular epidemiology of infectious hematopoietic necrosis virus reveals complex virus traffic and evolution within southern Idaho aquaculture // Diseases of Aquatic Organisms. Vol. 55. P. 175–185.Troyer R.M., Kurath G. Molecular epidemiology of infectious hematopoietic necrosis virus reveals complex virus traffic and evolution within southern Idaho aquaculture // Diseases of Aquatic Organisms. 2003. Vol. 55. P. 175–185.Watson S.W., Guenther R.W., Rucker R.R. 1954. A virus disease of sockeye salmon, interim report // US Fish and Wildlife Service Special Scientific Report on Fisheries. № 138. P. 1–36.Watson S.W., Guenther R.W., Rucker R.R. A virus disease of sockeye salmon, interim report. US Fish and Wildlife Service Special Scientific Report on Fisheries. 1954. № 138. P. 1–36.Williams I.V., Amend D.F. 1976. A natural epizootic of infectious hematopoietic necrosis in fry of sockeye salmon (Oncorhynchus nerka) at Chilko Lake, British Columbia // Journal of the Fisheries Research Board of Canada. № 33 (7). P. 1564–1567.Williams I.V., Amend D.F. A natural epizootic of infectious hematopoietic necrosis in fry of sockeye salmon (Oncorhynchus nerka) at Chilko Lake, British Columbia // Journal of the Fisheries Research Board of Canada. 1976. № 33 (7). P. 1564–1567.Wolf K. 1988. Fish viruses and fish viral diseases // U.S. Fish and Wildlife service. Ithaca, London. 478 p.Wolf K. Fish viruses and fish viral diseases // U.S. Fish and Wildlife service. Ithaca, London. 1988. 478 p.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.