ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ НЕРКИ ONCORHYNCHUS NERKA (WALBAUM, 1792) БАССЕЙНА Р. КАМЧАТКИ
https://doi.org/10.15853/2072-8212.2019.53.41-56
Аннотация
Исследована аллельная изменчивость десяти микросателлитных локусов нерки (Ots107, Okfi1a, Okfi1b, One104, One109, OtsG68, Omm1037, Okfi6, Ots100, Ots2) в бассейне р. Камчатки. Включенные в анализ выборки образовали несколько генетически обособленных групп: «оз. Азабачье» (ранняя и поздняя), «верхнее течение р. Камчатки», «среднее течение р. Камчатки». На долю межгрупповой компоненты молекулярного разнообразия приходится 1,83%, что превосходит дисперсию между выборками внутри групп (0,56%).
Об авторах
О. А. Пильганчук
Камчатский филиал Всероссийского научно-исследовательского института рыбного хозяйства и океанографии («КамчатНИРО»)
Россия
Россия
Н. Ю. Шпигальская
Камчатский филиал Всероссийского научно-исследовательского института рыбного хозяйства и океанографии («КамчатНИРО»)
Россия
Россия
А. Д. Денисенко
Камчатский филиал Всероссийского научно-исследовательского института рыбного хозяйства и океанографии («КамчатНИРО»)
Россия
Россия
В. В. Савенков
Камчатский филиал Всероссийского научно-исследовательского института рыбного хозяйства и океанографии («КамчатНИРО»)
Россия
Россия
Список литературы
1. Алтухов Ю.П. 1974. Популяционная генетика рыб. М.: Пищ. пром-сть. 245 с.
2. Алтухов Ю.П. 1983. Генетические процессы в популяциях. М.: Наука. 279 с.
3. Алтухов Ю.П., Салменкова Е.А., Омельченко В.Т. 1997. Популяционная генетика лососевых рыб. М.: Наука. 288 с.
4. Брыков Вл.А., Полякова Н.Е., Подлесных А.В. 2003. Дивергенция митохондриальной ДНК в популяциях нерки (Oncorhynchus nerka Walbaum) озера Азабачьего (Камчатка) // Генетика. Т. 39. № 12. С. 1687–1692.
5. Бугаев В.Ф. 1986. Методика идентификации в уловах прибрежного и речного промысла особей основных локальных стад и группировок нерки Oncorhynchus nerka (Walbaum) в бассейне р. Кам- чатка // Вопр. ихтиологии. Т. 26. Вып. 4. С. 600–609.
6. Бугаев В.Ф. 1995. Азиатская нерка (пресноводный период жизни, структура локальных стад, динами- ка численности). М.: Колос. 464 с.
7. Бугаев В.Ф. 2010. Нерка реки Камчатки (биология, численность, промысел). Петропавловск-Камчат- ский: Камчатпресс. 232 с.
8. Варнавская Н.В. 2006. Генетическая дифференциа- ция популяций тихоокеанских лососей. Петропав- ловск-Камчатский: КамчатНИРО. 488 с.
9. Васильковский М.Г. 1973. Ресурсы поверхностных вод. Т. 20. Камчатка. Л.: Гидрометеоиздат. 368 с. Вейр Б. 1995. Анализ генетических данных. М.: Мир. 400 с.
10. Глубоковский М.К. 1995. Эволюционная биология лососевых рыб. М.: Наука. 343 с.
11. Горшкова Г.В. 1978. Хромосомный полиморфизм нерки озера Азабачьего / Тез. докл. II Всесоюз. совещ. по биохим. генетике, кариологическому полиморфизму и мутагенезу у рыб. 14–17 марта, Ленинград. М. С. 4–5.
12. Коновалов С.М. 1980. Популяционная биология тихоокеанских лососей. М.: Наука. 1980. 238 с.
13. Крогиус Ф.В. 1970. О различных типах чешуи красной Oncorhynchus пеrkа (Walb.) в бассейне р. Камчатка и времени образования годового кольца // Изв. ТИНРО. Т. 74. С. 67–81.
14. Крогиус Ф.В. 1983. Сезонные расы красной Oncorhynchus nerka (Walb.) и ее нерестилища в водоемах Камчатки / Биологические основы раз- вития лососевого хозяйства в водоемах СССР. М.: Наука. С. 18–31.
15. Куренков И.И. 1972. Гидробиологическая характеристика оз. Азабачье по материалам 1949–1963 гг. // Изв. ТИНРО. Т. 82. С. 33–49.
16. Куренков И.И. 2005. Зоопланктон озер Камчатки. Петропавловск-Камчатский: КамчатНИРО. 178 с.
17. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. 1984. Молекулярное клонирование. М.: Мир. 479 с.
18. Пильганчук О.А., Шпигальская Н.Ю. 2013. Популяционно-генетическая дифференциация нерки Oncorhynchus nerka (Walbaum, 1792) восточного побережья Камчатки // Биология моря. Т. 39. № 5. С. 371–379.
19. Пильганчук О.А., Шпигальская Н.Ю., Савенков В.В., Сараванский О.Н., Базаркин Г.В., Ельни- ков А.Н. 2013. Изменчивость микросателлитных локусов нерки Oncorhynchus nerka (Walbaum, 1792) восточного побережья Камчатки // Биология моря. Т. 39. № 4. С. 272–280.
20. Пустовойт С.П. 1993. Генетическая гетерогенность нерестового стада нерки, Oncorhynchus nerka (Walb.), р. Камчатка // Генетика. Т. 29. №. 5. С. 808–819.
21. Пустовойт С.П., Макоедов А.Н. 1992. Генетическая и фенетическая изменчивость нерки, Oncorhynchus nerka (Walbaum), р. Камчатка // Генетика. Т. 28. № 6. С. 141–149.
22. Хрусталева А.М. 2018. Исследование приспособи- тельного характера полиморфизма главного ком- плекса гистосовместимости (МНС) по однонукле- отидным заменам в популяциях азиатской нерки. Сообщ. 2. Факторы, определяющие изменчивость гена Onne-DAB в бассейне реки Камчатка // Гене- тика. Т. 54. № 11. С. 1298–1308.
23. Хрусталева А.М., Пономарева Е.В., Пономарева М.В., Шубина Е.А., Углова Т.Ю., Кловач Н.В. 2018. Исследование приспособительного характера полиморфизма главного комплекса гистосовместимости (МНС) по однонуклеотидным заменам в по- пуляциях азиатской нерки. Сообщ. 1. В популяциях нерки рек Озерная и Камчатка действуют разные формы отбора. Генетика. Т. 54. № 10. С. 1177–1187.
24. Banks M.A., Bloufin M.S., Baldwfin B.A., Rashbrook V.K., Ffitzgerald H.A., Blankenshfip S.M., Hedgecock D. 1999. Isolatfion and finherfitance of novel mficrosatellfites fin chfinook salmon (Oncorhynchus tshawytscha) // J. Hered. Vol. 90. P. 281–288.
25. Beacham T.D., McIntosh B., MacConnachfie C., Mfiller K.M., Wfithler R.E., Varnavskaya N.V. 2006a. Pacfific Rfim populatfion structure of sockeye salmon (Oncorhynchus nerka) as determfined from mficrosatellfite analysfis // Trans. Amer. Ffish. Soc. Vol. 135. P. 174–187.
26. Beacham T.D., Varnavskaya N.V., McIntosh B., Mac- Connachfie C. 2006b. Populatfion structure of sockeye salmon (Oncorhynchus nerka) from Russfia determfined wfith mficrosatellfite DNA varfiatfion // Trans. Amer. Ffish. Soc. Vol. 135. P. 97–109.
27. Benjamfinfi Y., Hochberg Y. 1995. Controllfing the false dfiscovery rate: a practfical and powerful approach to multfiple testfing // Journal of the Royal Statfistfical Socfiety B. Vol. 57 (1). P. 289–300.
28. Excoffier L., Laval G., Schnefider S. 2005. Arlequfin ver. 3.0: An fintegrated software package for populatfion genetfics data analysfis // Evol. Bfiofinformatfics Onlfine. Vol. 1. P. 47–50.
29. Lewfis P.O., Zaykfin D.Yu. 2001. Genetfic data analysfis: computer program for the analysfis of allelfic data. http://lewfis.eeb.uconn.lewfishome/software.html.
30. Nefi M. 1987. Molecular evolutfionary genetfics. N.Y.: Columbfia Unfiv. press. 512 p.
31. Nelson R.J., Beacham T.D. 1999. Isolatfion cross specfies amplfifficatfion of mficrosatellfite locfi useful for study of Pacfific salmon // Anfimal Genetfics. Vol. 30. P. 228–229.
32. Olsen J.B., Wfilson S.L., Kretschmer E.J., Jones K.C., Seeb J.E. 2000. Characterfizatfion of 14 tetranucleotfide mficrosatellfite locfi derfived from sockeye salmon // Mol. Ecol. Vol. 9. P. 2185–2187.
33. Prfitchard J.K., Stefens M., Donnelly P. 2000. Inference of populatfion structure usfing multfilocus genotype data // Genetfics. Vol. 155. P. 945–959.
34. Rexroad III C.E., Coleman R.L., Gustafson A.L., Hershberger W.K., Kfillefer J. 2002. Development of rafinbow trout mficrosatellfite markers from repeat enrfiched lfibrarfies // Mar. Bfiotechnol. Vol. 4 (1). P. 12–16.
35. Sambrook J., Frfitsch E.F., Manfiatfis T. 1989. Molecular Clonfing: A Laboratory Manual. N.Y.: Cold Sprfing Harbor Lab. Press. 1626 p.
36. Schnefider S., Roesslfi D., Excoffier L. 2000. Arlequfin ver. 2.000: A software for populatfion genetfics data analysfis. Genetfics and Bfiometry Laboratory. Unfiv. Geneva. Swfitzerland.
37. Smfith C.T., Koop B.F., Nelson R.J. 1998. Isolatfion and characterfizatfion of coho salmon (Oncorhynchus kfisutch) mficrosatellfites and thefir use fin other salmonfids // Mol. Ecol. Vol. 7. P. 1613–1621.
38. Sokal R.R., Mfichener C.D. 1958. A statfistfical method for evaluatfing systematfic relatfionshfips. In: Unfiversfity of Kansas Scfience Bulletfin. P. 1409–1438.
39. Wfillfiamson K.S., Cordes J.F., May B. 2002. Characterfizatfion of mficrosatellfite locfi fin chfinook salmon (Oncorhyncus tshawytscha) and cross-specfies amplfificatfion fin other salmonfids // Mol. Ecol. Notes. Vol. 2. P. 17–19.
Рецензия
Для цитирования:
Пильганчук О.А., Шпигальская Н.Ю., Денисенко А.Д., Савенков В.В. ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ НЕРКИ ONCORHYNCHUS NERKA (WALBAUM, 1792) БАССЕЙНА Р. КАМЧАТКИ. Исследования водных биологических ресурсов Камчатки и северо-западной части Тихого океана. 2019;1(53):41-56. https://doi.org/10.15853/2072-8212.2019.53.41-56
For citation:
Pfilganchuk O.A., Shpfigalskaya N.Yu., Denfisenko A.D., Savenkov V.V. GENETIC DIFFERENTIATION OF SOCKEYE SALMON ONCORHYNCHUS NERKA (WALBAUM, 1792) IN THE BASIN OF KAMCHATKA RIVE. The researches of the aquatic biological resources of Kamchatka and the North-West Part of the Pacific Ocean. 2019;1(53):41-56. (In Russ.) https://doi.org/10.15853/2072-8212.2019.53.41-56
Просмотров:
185
Послать статью по эл. почте 