Differentiation of walleye pollock (Theragra chalcogramma) of the Sea of Okhotsk based on the microsatellite loci
https://doi.org/10.15853/2072-8212.2018.48.5-18
Abstract
Results of examination of the variety of 10 microsatellite loci (Gmo34, Gmo35, PGmo32, Gmo3, Gmа102, Gmа106, Gmа108, Gmo-G18, Gmo-С83, Gmo-С86) in samples of walleye pollock from the Sea of Okhotsk are represented in the article. It is demonstrated, that the best differentiators in case of walleye pollock in the Sea of Okhotsk are the loci Gmo-C86 and Gma106. A high level of individual genetic variety within examined samples is revealed. The clusters of the samples are of random nature. It has not found correlation between quantitative values of genetic differences of Fst samples and geographic distances between sampling locations. The hypothesis that there are separate populations in spawning districts was not confirmed on results of the research.
About the Authors
V. V. Savenkov
683000 Petropavlovsk-Kamchatsky, Naberezhnaya, 18
Russian Federation
Russian Federation
N. Yu. Shpigalskaya
683000 Petropavlovsk-Kamchatsky, Naberezhnaya, 18
Russian Federation
Russian Federation
A. I. Varkentin
683000 Petropavlovsk-Kamchatsky, Naberezhnaya, 18
Russian Federation
Russian Federation
O. A. Pilganchuk
683000 Petropavlovsk-Kamchatsky, Naberezhnaya, 18
Russian Federation
Russian Federation
U. O. Muravskaya
683000 Petropavlovsk-Kamchatsky, Naberezhnaya, 18
Russian Federation
Russian Federation
A. D. Denisenko
683000 Petropavlovsk-Kamchatsky, Naberezhnaya, 18
Russian Federation
Russian Federation
O. N. Saravansky
683000 Petropavlovsk-Kamchatsky, Naberezhnaya, 18
Russian Federation
Russian Federation
References
1. Глубоков А.И., Котенев Б.Н. 2006. Популяционная структура минтая Theragra chalcogramma северной части Берингова моря. М.: ВНИРО. 200 с.
2. Зверькова Л.М. 1981. Внутривидовая структура минтая в Охотском море / Экология, запасы и помысел минтая. Владивосток: ТИНРО. С. 41-56.
3. Кузнецов В.В., Котенев Б.Н., Кузнецова Е.Н. 2008. Популяционная структура, динамика численности и регулирование промысла минтая в северной части Охотского моря. М.: ВНИРО. 174 с.
4. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. 1984. Молекулярное клонирование. М.: Мир. 479 с.
5. Пушников В.В. 1978. Пространственная структура минтая Охотского моря // Изв. ТИНРО. Т. 102. С. 90-96.
6. Савенков В.В., Шпигальская Н.Ю., Варкентин А.И., Пильганчук О.А., Кустова А.С., Сараванский О.Н. 2012. Полиморфизм популяционно-генетических маркеров минтая северной части Охотского моря / Матер. Всерос. науч. конф. «Водные биологические ресурсы северной части Тихого океана: состояние, мониторинг, управление». Петропавловск-Камчатский: КамчатНИРО. С. 439-447.
7. Савенков В.В., Шпигальская Н.Ю., Варкентин А.И., Пильганчук О.А., Муравская У.О., Сараванский О.Н. 2014. Изменчивость микросателлитных локусов в выборках минтая из нерестовых скоплений Охотского, Берингова морей и тихоокеанских вод, прилегающих к Северным Курильским островам // Исслед. водн. биол. ресурсов Камчатки и сев.-зап. части Тихого океана. Сб. науч. тр. КамчатНИРО. Вып. 34. С. 72-80.
8. Сергеева Н.П., Варкентин А.И., Буслов А.В. 2011. Шкала стадий зрелости гонад минтая. Петропавловск-Камчатский: КамчатНИРО. 92 с.
9. Фадеев Н.С. 1987. Нерестилища и сроки размножения минтая северной части Охотского моря / Популяционная структура, динамика численности и экология минтая. Владивосток: ТИНРО. С. 5-23.
10. Флусова Г.Д., Богданов Л.В. 1986. Популяционная структура минтая по данным генетических исследований. Тресковые дальневосточных морей. Владивосток: ТИНРО. С. 79-88.
11. Флусова Г.Д. 1987. Популяционная структура минтая Theragra chalcogramma (Pallas) / Генетические исследования гидробионтов. Матер. III Всесоюз. совещ. по генетике, селекции и гибридизации рыб (г. Тарту, сентябрь 1986 г.). М. С. 80-94.
12. Шпигальская Н.Ю., Пильганчук О.А., Савенков В.В., Кустова А.С., Муравская У.О., Сараванский О.Н. 2012. Результаты исследований внутривидовой структуры промысловых видов рыб методами популяционной генетики // Исслед. водн. биол. ресурсов Камчатки и сев.-зап. части Тихого океана. Сб. науч. тр. КамчатНИРО. Вып. 25. С. 69-97.
13. Шубина Е.А., Глубоков А.И. 2003. Генетика субполярных рыб и беспозвоночных (обзор материалов 20-го симпозиума Лоуэлла Уэйкфилда). М.: ВНИРО. 39 с.
14. Шубина Е.А., Пономарева Е.В., Глубоков А.И. 2009. Популяционно-генетический анализ минтая Theragra chalcogramma (Teleostei, Gadidae) из Берингова и Охотского морей // Молекулярная биология. Т. 43, № 5. С. 918-930.
15. Шунтов В.П., Волков А.Ф., Темных О.С., Дулепова Е.П. 1993. Минтай в экосистемах дальневосточных морей. Владивосток: ТИНРО. 426 с.
16. Canino M.F., Spies I.B., Hauser L. 2005. Development and characterization of novel di- and tetranucleotide microsatellite markers in Pacific cod (Gadus macrocephalus) // Mol. Ecol. Notes. Vol. 5. P. 908-910.
17. Cavalli-Sforsa L.L., Edwards A.W.E. 1967. Phylogenetic analysis: models and estimation procedures // Am. J. Hum. Genet. Vol. 19. P. 233-257.
18. Miller K.M., Le K.D., Beacham T.D. 2000. Development of tri- and tetranucleotide repeat microsatellite loci in Atlantic cod (Gadus morhua) // Mol. Ecol. Notes. Vol. 9. № 2. P. 238-239.
19. Nei M. 1972. Genetic distance between populations // American Naturalist. Vol. 106 (949). P. 283-292.
20. O’Reilly P.T., Canino M., Baily K., Bentzen P. 2000. Isolation of twenty low stutters di- and tetranucleotide microsatellites for population analyses of waleye pollock and other gadoids // J. Fish Biol. Vol. 56. P. 1074-1086.
21. O’Reilly P.T., Canino M.F., Bailey K.M., Bentzen P. 2004. Inverse relationship between Fst and microsatellite polymorphism in the marine fish, walleye pollock (Theragra chalcogramma): implications for resolving weak population structure // Mol. Ecol. Vol. 13. P. 1799-1814.
22. Schneider S., Roessli D., Excoffier L. 2000. Arlequin ver. 2.000: A software for population genetics data analysis. Genetics and Biometry Laboratory, Univ. Geneva, Switzerland.
23. Stenvik J., Wesmajervi M.S., Fjalestad K., Damsgard B., Delghandi M. 2006. Development of 25 gene-associated microsatellite markers of Atlantic cod (Gadus morhua L.) // Mol. Ecol. Notes. Vol. 6. № 4. P. 1105-1107.
Review
For citations:
Savenkov V.V., Shpigalskaya N.Yu., Varkentin A.I., Pilganchuk O.A., Muravskaya U.O., Denisenko A.D., Saravansky O.N. Differentiation of walleye pollock (Theragra chalcogramma) of the Sea of Okhotsk based on the microsatellite loci. The researches of the aquatic biological resources of Kamchatka and the North-West Part of the Pacific Ocean. 2018;(48):5-18. (In Russ.) https://doi.org/10.15853/2072-8212.2018.48.5-18
Views:
205
Email this article 