Генетическая идентификация молоди горбуши Oncorhynchus gorbuscha (Walbaum) Охотоморского бассейна по результатам рестрикционного анализа митохондриальной ДНК и анализа однонуклеотидных полиморфизмов

Представлены данные о региональном составе морских смешанных скоплений молоди горбуши Охотоморского бассейна в период посткатадромных миграций 2021 г. Выявлена высокая вероятность значительного преобладания нерестовых возвратов горбуши южного комплекса стад и резкого снижения ее подходов в северные регионы в 2022 г. Идентификационные оценки молоди, полученные по результатам RFLP-анализа мтДНК и анализа аллельной изменчивости SNP-локусов, соотнесены с величинами фактических региональных уловов и нерестовых подходов. Отмечено близкое соответствие расчетных оценок и фактических данных для северного комплекса стад. Результаты генетической идентификации оказались несколько заниженными для Сахалино-Курильского региона и завышенными для южной части материкового побережья Охотского моря.

1. Бугаев А.В., Чистякова А.И., Урава С. 2020a. Многолетние тенденции распределения и регионального состава уловов заводской молоди горбуши и кеты в период осенних миграций в бассейне Охотского моря // Исслед. водн. биол. ресурсов Камчатки и сев.-зап. части Тихого океана. Вып. 57. С. 67–98.

2. Бугаев А.В., Шпигальская Н.Ю., Зикунова О.В., Артюхина Н.Б., Фельдман М.Г., Шубкин С.В., Коваленко М.Н. 2020б. Обзор итогов лососевой путины-2020 в Камчатском крае (Сообщение 1): Динамика и статистика промысла, оценки нерестового фонда // Бюллетень № 15 изучения тихоокеанских лососей на Дальнем Востоке. С. 17–43.

3. Зеленина Д.А., Косицына А.И., Сергеев А.А., Сошнина В.А., Шпигальская Н.Ю. 2022. Генетическая идентификация стад горбуши бассейна Охотского моря / Генетические процессы в популяциях: Матер. науч. конф. с междунар. участием, посвящ. 50-летнему юбилею лаборатории популяционной генетики им. Ю.П. Алтухова ИОГен РАН и 85-летию со дня рожд. ак. Ю.П. Алтухова (11−14 октября 2022 г., Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН, Москва). М.: Ваш Формат. С. 26.

4. Косицына А.И., Шпигальская Н.Ю., Савенков В.В., Денисенко А.Д. 2021. Генетическая идентификация молоди горбуши Охотоморского бассейна по материалам осенней траловой съемки 2020 г. / Матер. ХXII Междунар. науч. конф. «Сохранение биоразнообразия Камчатки и прилегающих морей». Петропавловск-Камчатский: Камчатпресс. С. 139–141.

5. Косицына А.И., Шпигальская Н.Ю., Сараванский О.Н. 2018. Идентификация молоди горбуши Охотоморского бассейна по материалам осенней траловой съемки 2017 г. // Перспективы рыболовства и аквакультуры в современном мире: Матер. III науч. школы молодых ученых и специалистов по рыбному хозяйству и экологии, посвящ. 140-летию со дня рожд. К.М. Дерюгина. М.: ВНИРО. С. 105.

6. Косицына А.И., Шпигальская Н.Ю., Сараванский О.Н. 2019. Региональная идентификация молоди горбуши Oncorhynchus gorbuscha (Walbaum) бассейна Охотского моря по материалам осенней траловой съемки 2018 г. / Сб. тез. Междунар. конгресса «VII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвящ. 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы» (Санкт-Петербург, 18–22 июня 2019 г.). С. 1029.

7. Шпигальская Н.Ю., Брыков Вл.А., Кухлевский А.Д., Сараванский О.Н., Климов А.В., Четвертак А.А., Шевляков Е.А. 2011. Региональная идентификация смешанных морских скоплений молоди горбуши (Oncorhynchus gorbuscha Walbaum) на основе изменчивости фрагмента Cytb/D-loop митохондриальной ДНК // Изв. ТИНРО. Т. 165. С. 89–103.

8. Шпигальская Н.Ю., Пильганчук О.А., Савенков В.В., Кустова А.С., Муравская У.О., Сараванский О.Н. 2012. Результаты исследований внутривидовой структуры промысловых видов рыб методами популяционной генетики // Исслед. водн. биол. ресурсов Камчатки и сев.-зап. части Тихого океана. Вып. 25. С. 69–97.

9. He C., Holme J., Anthony J. 2014. SNP genotyping: the KASP assay // Methods Mol Biol. Vol. 1145. P. 75–86.

10. Ivanova N.V., deWaard J., Hebert P.D.N. 2006. An inexpensive, automation-friendly protocol for recovering high-quality DNA // Mol. Ecol. Notes. Vol. 6. P. 998–1002.

11. Masuda M., Nelson S., Pella J. 1991. The computer programs for computing conditional maximum likely estimates of stock composition from discrete characters // NOAA Tech. Rep. NMFS № 244. Auke Bay Laboratory, Juneau, AK. 11 p.

12. Peakall R., Smouse P.E. 2006. GenAlEx 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research // Mol. Ecol. Notes. Vol. 6. P. 299–295.

13. Pella J., Masuda M., Nelson S. 1996. Search algorithms for computing stock composition of mixture from traits of individuals by maximum likelihood // NOAA Tech. Memo. NMFS-AFSC. № 61. 68 p.

14. Shpigalskaya N.Yu., Kositsina A.I., Muravskaya U.O., Saravansky O.N. 2016. Genetic identification of juvenile pink salmon improves accuracy of forecasts of spawning runs in the Okhotsk Sea basin // N. Pac. Anadr. Fish Comm. Bull. № 6. P. 415–420.