Исследование микросателлитной изменчивости нерки Oncorhynchus nerka (Walbaum, 1792) р. Большой
https://doi.org/10.15853/2072-8212.2022.66.68-78
Аннотация
В работе представлены результаты исследования генетической изменчивости у нерки р. Большой по семи микросателлитным локусам. Показано, что в бассейне р. Большой обитает стадо со сложной иерархической организацией. На основании данных по микросателлитной изменчивости в изучаемой локальности у нерки выявлены различные темпоральные группировки (ранняя и поздняя расы в оз. Начикинском) и экологические формы (речная и озерная).
Ключевые слова
популяционно-генетическая структура,
нерка (Oncorhynchus nerka),
микросателлитные локусы,
генетическая дифференциация
При поддержке: Работа выполнена в рамках госзадания ФГБНУ «ВНИРО» и при поддержке гранта Минобрнауки РФ (соглашение № 075-15-2021-1084).
Об авторах
О. А. Пильганчук
Камчатский филиал Всероссийского научно-исследовательского института рыбного хозяйства
и океанографии (КамчатНИРО)
Россия
Россия
канд. биол. наук, зав. лаб.
Петропавловск-Камчатский
У. О. Муравская
Камчатский филиал Всероссийского научно-исследовательского института рыбного хозяйства
и океанографии (КамчатНИРО)
Россия
Россия
специалист
Петропавловск-Камчатский
Д. А. Зеленина
Всероссийский научно-исследовательский институт рыбного хозяйства и океанографии (ВНИРО)
Россия
Россия
канд. биол. наук, вед. н. с.
Москва
Список литературы
1. Алтухов Ю.П. 2003. Генетические процессы в популяциях. М.: ИКЦ «Академкнига». 431 с.
2. Афанасьев К.И., Рубцова Г.А., Малинина Т.В., Салменкова Е.А., Омельченко В.Т., Животовский Л.А. 2006. Микросателлитная изменчивость и дифференциация популяций кеты (Oncorhynchus keta Walbaum), воспроизводимых сахалинскими рыбоводными заводами // Генетика. Т. 42. № 12. С. 1694–1702.
3. Бугаев В.Ф. 1995. Азиатская нерка (пресноводный период жизни, структура локальных стад, динамика численности). М.: Колос. 464 с.
4. Бугаев В.Ф., Остроумов А.Г., Непомнящий К.Ю., Маслов А.В. 2002. Некоторые особенности биологии нерки Oncorhynchus nerka р. Большой (Западная Камчатка) и факторы, влияющие на ее биологические показатели // Изв. ТИНРО. Т. 130- 2. С. 758–776.
5. Варнавская Н.В. 2006. Генетическая дифференциация популяций тихоокеанских лососей. Петропавловск-Камчатский: КамчатНИРО. 488 с.
6. Варнавская Н.В., Варнавский В.С., Вецлер И.И., Непомнящий К.Ю. 1988. Особенности пространственной генетической дифференциации популяций нерки (Oncorhynchus nerka Walbaum) Начикинского, Двухюрточного, Дальнего и Ближнего озер (Камчатка) // Генетика. Т. 24. № 4. С. 723–731.
7. Вейр Б. 1995. Анализ генетических данных. М.: Мир, 400 с.
8. Запорожец О.М., Запорожец Г.В. 2013. Структура запасов нерки бассейна р. Большой (Западная Камчатка) в период 1986–2012 гг. // Сохранение биоразнообразия Камчатки и прилегающих морей: доклады ХII–XIII Междунар. науч. конф. (Петропавловск-Камчатский, 14 декабря 2011 г., 15 ноября 2012 г.). Петропавловск-Камчатский: Камчатпресс. С. 107–116.
9. Запорожец О.М., Запорожец Г.В. 2022. Производители нерки в бассейне Начикинского озера (Юго-Западная Камчатка): биология и численность // Изв. ТИНРО. Т. 202. № 2. С. 351–368.
10. Запорожец О.М., Запорожец Г.В., Фельдман М.Г. 2020а. Оценка численности производителей нерки и их распределение по нерестовым стациям в бассейне Начикинского озера (Камчатка) в 2019 // Изв. ТИНРО. Т. 200, № 3. С. 618–634.
11. Запорожец О.М., Запорожец Г.В., Фельдман М.Г. 2020б. Исследования нереста нерки в бассейне Начикинского озера (Юго-Западная Камчатка) с помощью квадрокоптера в 2018 г. / Исслед. водн. биол. ресурсов Камчатки и сев.-зап. части Тихого океана. Вып. 56. С. 35–62.
12. Зеленина Д.А., Хрусталева А.М., Волков А.А. 2006. Сравнительное исследование популяционной структуры и определение популяционной принадлежности нерки (Oncorhynchus nerka) Западной Камчатки с помощью RAPD-PCR и анализа полиморфизма микросателлитных локусов // Генетика. Т. 42, № 5. С. 693–704.
13. Коновалов С.М., Шевляков А.Г. 1980. Наследование размеров, формы и массы тела у тихоокеанских лососей // Популяционная биология и систематика лососевых. Владивосток: ИБМ ДВНЦ АН СССР. С. 30–50.
14. Крохин Е.М. 1960. Нерестилища красной Oncorhynchus nerka Walb. (очерк геоморфологии, температурного режима и гидрохимии) // Вопр. ихтиологии. Т. 16. С. 89–110.
15. Крохин Е.М., Крогиус Ф.В. 1937. Очерк бассейна р. Большой и нерестилищ лососевых, расположенных в нем // Изв. ТИНРО. Т. 9. 157 с.
16. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. 1984. Молекулярное клонирование. М.: Мир. 479 с.
17. Пильганчук О.А., Шпигальская Н.Ю., Денисенко А.Д. 2017. Изменчивость микросателлитных локусов нерки Oncorhynchus nerka (Walbaum, 1792) западного побережья Камчатки, материкового побережья Охотского моря и Курильских островов / Водные биологические ресурсы России: состояние, мониторинг, управление: Матер. Всерос. науч. конф. (Петропавловск-Камчатский, 03–06 октября 2017 г.). Петропавловск-Камчатский: КамчатНИРО. С. 190–194.
18. Пильганчук О.А., Шпигальская Н.Ю., Денисенко А.Д., Савенков В.В. 2019. Генетическая дифференциация нерки Oncorhynchus nerka (Walbaum, 1792) бассейна р. Камчатки // Исслед. водн. биол. ресурсов Камчатки и сев.-зап. части Тихого океана. Вып. 53. С. 41–56.
19. Пильганчук О.А., Шпигальская Н.Ю., Савенков В.В., Сараванский О.Н., Базаркин Г.В., Ельников А.Н. 2013. Изменчивость микросателлитных локусов нерки Oncorhynchus nerka (Walbaum, 1792) восточного побережья Камчатки // Биология моря. Т. 39, № 4. С. 272–280.
20. Хрусталева А.М. 2010. Вариабельность размерно-возрастных показателей и генетическая изменчивость нерки Oncorhynchus nerka западного побережья Камчатки: сравнительный анализ методов дифференциации локальных популяций // Вопр. ихтиологии. Т. 50, № 3. С. 305–317.
21. Хрусталева А.М., Волков А.А., Стоклицкая Д.С., Мюге Н.С., Зеленина Д.А. 2010. Сравнительный анализ изменчивости STRи SNP-локусов в популяциях нерки (Oncorhynchus nerka) Восточной и Западной Камчатки // Генетика. Т. 46, № 11. С. 1544–1555.
22. Хрусталева А.М., Пономарева Е.В., Пономарева М.В., Кловач Н.В. 2017. Исследование однонуклеотидного полиморфизма ДНК в популяциях нерки Камчатки, северо-западного побережья Охотского моря и Чукотки // Изв. ТИНРО. Т. 190. С. 18–32.
23. Benjamini Y., Hochberg Y. 1995. Controlling the false discovery rate: a practical and powerful approach to multiple testing // Journal of the Royal Statistical Society B. Vol. 57 (1). P. 289–300.
24. Botstein D., White R.L., Skolnick M.H., Davis R.W. 1980. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms // Am. J. Hum. Genet. Vol. 32. P. 314–331.
25. Excoffier L., Lischer H.E.L. 2010. Arlequin suite ver 3.5: a new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows // Mol. Ecol. Res. Vol. 10. P. 564–567. https://doi.org/10.1111/j.1755-0998.2010.02847.x
26. Goudet J. 1995. FSTAT (version 1.2): a computer program to calculate F-statistics // J. Heredity. Vol. 86. P. 485–486.
27. Lewis P.O., Zaykin D. 2001. Genetic data analysis: computer program for the analysis of allelic data. Version 1.0 (d16c). Free program distributed by the authors over the internet from http://lewis.eeb.uconn.edu/lewishome/software.html.
28. Nei M. 1987.Molecular evolutionary genetics. N.Y.: Columbia Univ. press. 512 p.
29. Nelson R.J., Beacham T.D. 1999. Isolation cross species amplification of microsatellite loci useful for study of Pacific salmon // Animal Genetics. Vol. 30. P. 228–229.
30. Olsen J.B., Wilson S.L., Kretschmer E.J., Jones K.C., Seeb J.E. 2000. Characterization of 14 tetranucleotide microsatellite loci derived from sockeye salmon // Mol. Ecol. Vol. 9. P. 2185–2187.
31. Peakall R., Smouse P.E. 2006. GENALEX 6: Genetic analysis in excel. population genetic software for teaching and research // Mol. Ecol. Vol. 6. P. 288–295. Pritchard J.K., Stefens M., Donnelly P. 2000 Inference of population structure using multilocus genotype data // Genetics. Vol. 155. P. 945–959.
32. Smith C.T., Koop B.F., Nelson R.J. 1998. Isolation and characterization of coho salmon (Oncorhynchus kisutch) microsatellites and their use in other salmonids // Mol. Ecol. Vol. 7. P. 1613–1621.
33. Van Oosterhout C., Hutchinson W.F., Wills D.P.M., Shipley P. 2004. Micro-checker: software for identifying and correcting genotyping errors in microsatellite data // Mol. Ecol. Notes. Vol. 4. № 3. P. 535–538.
34. Williamson K.S. , Cordes J.F. , May B. 2002. Characterization of microsatellite loci in Chinook salmon (Oncorhyncus tshawytscha) and crossspecies amplification in other salmonids // Mol. Ecol. Notes. Vol. 2. P. 17–19.
Рецензия
Для цитирования:
Пильганчук О.А., Муравская У.О., Зеленина Д.А. Исследование микросателлитной изменчивости нерки Oncorhynchus nerka (Walbaum, 1792) р. Большой. Исследования водных биологических ресурсов Камчатки и северо-западной части Тихого океана. 2022;(66):68-78. https://doi.org/10.15853/2072-8212.2022.66.68-78
For citation:
Pilganchuk O.A., Muravskaya U.O., Zelenina D.A. Study of sockeye salmon Oncorhynchus nerka (Walbaum, 1792) microsatellite variability in Bolshaya River. The researches of the aquatic biological resources of Kamchatka and the North-West Part of the Pacific Ocean. 2022;(66):68-78. (In Russ.) https://doi.org/10.15853/2072-8212.2022.66.68-78
Просмотров:
196
Послать статью по эл. почте 